RDKit のインストール
Psi4 のインストール
tar コマンドで特定ファイルを除外して圧縮する方法
Slack Bot を活用した研究室の出席管理システムを作ろう
Intel MKL のインストール
GAMESS のインストールガイド(Ubuntu 24.04 向け)
エチレンの円錐交差構造を探索する
Matbench Discovery:機械学習ポテンシャルのベンチマーク
systemd の設定項目
Nginx のリバースプロキシ設定
Singularity を使ってみよう
Xserver で FastAPI を利用するときの .htaccess の設定
React アプリで環境変数を正しく使うために
QM/MM Free Energy Perturbation (FEP) 法:基礎編
思いつきで作ったアプリのリスト
Nudged Elastic Band (NEB) 法で最小エネルギー経路を探索しよう
Qubit Duo: Let's Play with Quantum Bits!
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地球温暖化と温室効果ガス:温室効果ガスとの関わりを理解しよう
分子軌道ぬりえ
React プロジェクトへの Tailwind CSS の導入と使い方
Mac で React プロジェクトを作成し GitHub にデプロイする
卒論・修論チェックリスト(Version 2.0)
Luma AI Dream Machine で静止画像から動画を作ってみる
香りの化学:香りの不思議を解き明かそう
量子化学計算入門講座
エネルギー(eV)を波長(nm)に変換する
同じ分子なのに原子の並び方が合っていない2つの構造データを適切に並べ替える
String method for finding the minimum energy path on PES
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フォルダ構造図をテキスト(ASCII)で生成する Web アプリのメモ
Hugo:分子の構造データを読み込んで表示するときのお手軽ショートコード
MacOS の sed で上書きオプションなどが使えなかったりするときの対処
Hugo:コードブロックに SMILES を指定するだけで化学構造を表示する
ホタル生物発光の量子化学計算:Gaussian を使った ONIOM TD-DFT 計算
Obsidianのキーボードショートカット
Hugo:コードブロックに xyz 座標を指定するだけで分子を立体表示する
このサイトの Markdown + α 記法
Turbomole を用いた量子化学計算の基本的な手順:エチレンの DFT 計算を例として
VSCode で ファイルを保存するたびに Pixela のグラフをインクリメント(草を生やす)
Newton-X 2.6 と DFTB+ 24.1 の組み合わせで非断熱ダイナミクスを実行するための前準備
Mac でファイルの変更を検出する: fswatch の使い方
Plausible のデータを定期的に取得して過去 30 日間のアクセス数を表示する
DFTB+ 24.1 の modes ツールにあった些細だけどまあまあ致命的なバグ
DFTB+ 24.1 をインストール
LaTeX で Gaussian の入力ファイルをシンタックスハイライト
LaTeX 超入門
Overleaf で pLaTeX を使う
Newton-X を分子研スパコンでちょっと使ってみる
cpptrajでタンパク質周囲5Å以内にある水分子を抽出する
9999 残基以上あるときに cpptraj で PDB ファイルを出力するときの注意
VMDで基質周囲5Å以内にある水分子だけを表示する
これまでに出版されている量子化学計算のテキストをまとめてみた
PuzMol ペーパークラフト版のパッケージデザインができた
紙芝居プレゼン(KP)メソッドをお手軽に
Slackの教育支援プログラムに申し込んだ
Blueskyのアカウントを作った
卒論・修論チェックリスト
JSmol:分子の立体構造を可視化する JavaScript フレームワーク
HugoのTips:画像にキャプションを付ける
pipの覚え書き
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mdBookで授業資料を作る
Dear Isasaka-sensei
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キャロルの学校時間モデル
App Storeで購入したアプリの領収書を発行する
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Scrapbox を授業で活用しよう
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教師向けの GitHub Global Campus に応募した
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Slido の有料プランに課金した
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XserverにPython環境を構築
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