Moleculatioの内部で採用している技術と計算条件などのまとめ
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macFUSE & SSHFSで実現するリモートファイルの快適アクセス
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2原子分子の分子軌道ができる様子をアニメーションで見てみよう
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WebMOで使える量子化学計算プログラム
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Mac に Node.js をインストールする
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Gaussian 16 の MacOSX 版を Apple シリコンで動作させる
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Warp を MacOS にインストール
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Miniconda を Mac にインストールする
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日本語プログラミングフォント HackGen を MacOS にインストール
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Minicondaをアンインストールする
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Miniconda を Linux にインストールする
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Linux ディストリビューションを確認する
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Gaussian の Scan 計算から結果を抽出する
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デフォルトの shell を変更する
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RDKit のインストール
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Psi4 のインストール
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tar コマンドで特定ファイルを除外して圧縮する方法
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Slack Bot を活用した研究室の出席管理システムを作ろう
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Intel MKL のインストール
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GAMESS のインストールガイド(Ubuntu 24.04 向け)
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エチレンの円錐交差構造を探索する
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Matbench Discovery:機械学習ポテンシャルのベンチマーク
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systemd の設定項目
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Nginx のリバースプロキシ設定
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Singularity を使ってみよう
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Xserver で FastAPI を利用するときの .htaccess の設定
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React アプリで環境変数を正しく使うために
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QM/MM Free Energy Perturbation (FEP) 法:基礎編
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思いつきで作ったアプリのリスト
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Nudged Elastic Band (NEB) 法で最小エネルギー経路を探索しよう
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Qubit Duo: Let's Play with Quantum Bits!
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Qubit Duo: 量子ビットで遊ぼう!
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地球温暖化と温室効果ガス:温室効果ガスとの関わりを理解しよう
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分子軌道ぬりえ
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React プロジェクトへの Tailwind CSS の導入と使い方
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Mac で React プロジェクトを作成し GitHub にデプロイする
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卒論・修論チェックリスト(Version 2.0)
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Luma AI Dream Machine で静止画像から動画を作ってみる
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香りの化学:香りの不思議を解き明かそう
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量子化学計算入門講座
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エネルギー(eV)を波長(nm)に変換する
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同じ分子なのに原子の並び方が合っていない2つの構造データを適切に並べ替える
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String method for finding the minimum energy path on PES
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このサイトで使っているカラーとアイコン
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フォルダ構造図をテキスト(ASCII)で生成する Web アプリのメモ
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Hugo:分子の構造データを読み込んで表示するときのお手軽ショートコード
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MacOS の sed で上書きオプションなどが使えなかったりするときの対処
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Hugo:コードブロックに SMILES を指定するだけで化学構造を表示する
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ホタル生物発光の量子化学計算:Gaussian を使った ONIOM TD-DFT 計算
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Obsidianのキーボードショートカット
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Hugo:コードブロックに xyz 座標を指定するだけで分子を立体表示する
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このサイトの Markdown + α 記法
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Turbomole を用いた量子化学計算の基本的な手順:エチレンの DFT 計算を例として
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VSCode で ファイルを保存するたびに Pixela のグラフをインクリメント(草を生やす)
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Newton-X 2.6 と DFTB+ 24.1 の組み合わせで非断熱ダイナミクスを実行するための前準備
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Mac でファイルの変更を検出する: fswatch の使い方
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Plausible のデータを定期的に取得して過去 30 日間のアクセス数を表示する
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DFTB+ 24.1 の modes ツールにあった些細だけどまあまあ致命的なバグ
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DFTB+ 24.1 をインストール
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LaTeX で Gaussian の入力ファイルをシンタックスハイライト
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LaTeX 超入門
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Overleaf で pLaTeX を使う
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Newton-X を分子研スパコンでちょっと使ってみる
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cpptrajでタンパク質周囲5Å以内にある水分子を抽出する
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9999 残基以上あるときに cpptraj で PDB ファイルを出力するときの注意
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VMDで基質周囲5Å以内にある水分子だけを表示する
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これまでに出版されている量子化学計算のテキストをまとめてみた
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PuzMol ペーパークラフト版のパッケージデザインができた
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紙芝居プレゼン(KP)メソッドをお手軽に
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Slackの教育支援プログラムに申し込んだ
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Blueskyのアカウントを作った
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卒論・修論チェックリスト
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JSmol:分子の立体構造を可視化する JavaScript フレームワーク
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HugoのTips:画像にキャプションを付ける
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pipの覚え書き
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mdBookでテーマファイルを作るときのTips
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condaの覚え書き
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Dear Isasaka-sensei
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Cloudinaryに画像をアップするフォルダアクション
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キャロルの学校時間モデル
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App Storeで購入したアプリの領収書を発行する
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I've contracted COVID-19
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svg 形式のアイコンを Scrapbox のタイトル画像用に整えるブックマークレット
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Scrapbox を授業で活用しよう
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mdBook の Tips : 入力する Markdown ファイルを1つだけで済ませる
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Python で簡易 Web サーバー
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mdBook でクイズを出題
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cargo の tips
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教師向けの GitHub Global Campus に応募した
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サイトのカラーリングを「心を落ち着かせる色」にしてみた
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mdBook を使ってみる
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code コマンドを使えるようにする
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気になるニュース:鎌状赤血球症の遺伝子編集治療
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しずかなインターネットっていいな
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Slido の有料プランに課金した
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調和型関数 vs モース型関数:可視化して比較
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構造最適化の説明に使えそうなグラフを描く
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分極関数のはたらきを可視化する
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スレーター型基底 vs ガウス型基底:可視化して比較
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XserverにPython環境を構築
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2原子分子の分子軌道のLCAO近似を可視化する
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ChatGPTにお願いしたら一週間でWebアプリができた
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Scrapbox の Tips : 更新状況を可視化する
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Obsidian の Tips : 現在編集している Hugo コンテンツをプレビュー
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スタバのタンブラー
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Hugo の Tips : 迷惑メール対策 + メアドをコピー
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Gyazo.com に画像をアップするフォルダアクション
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PuzMol.com を作ったときのメモ
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だいたい何でも箇条書き
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Scrapbox で書くこと vs このサイトで書くこと
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Blot の Tips : ファイルを隠す
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PuzMol 作品 : お酒の化学
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Pixela : 活動記録をヒートマップで表示するサービス
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Obsidian での作業状況を可視化する
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code ブロックに「コピーボタン」を設置する
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Intel oneAPI Toolkit 2023 をインストール
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Amazon 商品用のブログカード - HTML 版
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4つの大切なC : Adlerian 心理学
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NBO で水素結合を解析するときの注意点
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ヤマラボのホームページをリニューアル
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ある領域の学びから多くの収穫を得るための8つの問い
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日本語 Google Fonts をサブセット化して軽量に
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Lucide : オープンソースのアイコン集
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Hugo の Tips : Amazon 商品用のブログカード
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MacOS に HackGen フォントをインストール
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Blog を Scrapbox 風に
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ちょっとだけ賢い「戻る」ボタン
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着任してから・退職するまで何日?
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中谷宇吉郎「雪」
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Blot - Dropbox blogging platform
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