Gaussian 16 の MacOSX 版を Apple シリコンで動作させる

WebMOで使える量子化学計算プログラム

Gaussian の Scan 計算から結果を抽出する

GAMESS のインストールガイド（Ubuntu 24.04 向け）

エチレンの円錐交差構造を探索する

Matbench Discovery：機械学習ポテンシャルのベンチマーク

QM/MM Free Energy Perturbation (FEP) 法：基礎編

Nudged Elastic Band (NEB) 法で最小エネルギー経路を探索しよう

量子化学計算入門講座

同じ分子なのに原子の並び方が合っていない２つの構造データを適切に並べ替える

String method for finding the minimum energy path on PES

ホタル生物発光の量子化学計算：Gaussian を使った ONIOM TD-DFT 計算

Turbomole を用いた量子化学計算の基本的な手順：エチレンの DFT 計算を例として

Newton-X 2.6 と DFTB+ 24.1 の組み合わせで非断熱ダイナミクスを実行するための前準備

DFTB+ 24.1 の modes ツールにあった些細だけどまあまあ致命的なバグ

DFTB+ 24.1 をインストール

Newton-X を分子研スパコンでちょっと使ってみる

9999 残基以上あるときに cpptraj で PDB ファイルを出力するときの注意

cpptrajでタンパク質周囲５Å以内にある水分子を抽出する

VMDで基質周囲５Å以内にある水分子だけを表示する

これまでに出版されている量子化学計算のテキストをまとめてみた